Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM7Q9BQ49 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms