Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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