Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms