Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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