Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HECW1Q76N89 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms