Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms