Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN3Q4LDR2 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms