Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms