Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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