Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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