Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms