Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms