Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOMO3P69849 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOMO3P69849 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOMO3P69849 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms