Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RHBDL3-203ENST00000536287 4470 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 EFHC1-201ENST00000371068 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZAN-207ENST00000620596 8396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NRP1-206ENST00000374867 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms