Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHBDL3P58872 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms