Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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