Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms