Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPOP42166 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMPOP42166 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms