Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms