Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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