Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms