Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDSP20132 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDSP20132 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SDSP20132 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SDSP20132 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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