Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms