Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
IFITM1P13164 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms