Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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