Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms