Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZDHHC18Q9NUE0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms