Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MCMBPQ9BTE3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms