Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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