Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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