Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms