Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms