Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms