Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 OPRM1-211ENST00000518759 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CCDC103-203ENST00000410027 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 RPL10P12-201ENST00000427342 318 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AL390726.1-201ENST00000451357 202 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AL596094.1-201ENST00000608273 276 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 Metazoa_SRP.82-201ENST00000611637 265 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TXN2-204ENST00000416967 1280 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC015909.2-201ENST00000523083 547 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms