Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-7■□□□□ 10.2
PCBP2Q15366 PDIA5-204ENST00000472319 395 ntTSL 57.01□□□□□ -1.293e-6■□□□□ 10.2
PCBP2Q15366 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.576e-13■□□□□ 10.2
PCBP2Q15366 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.576e-13■□□□□ 10.2
PCBP2Q15366 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.316e-13■□□□□ 10.2
PCBP2Q15366 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.136e-13■□□□□ 10.2
PCBP2Q15366 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.116e-13■□□□□ 10.2
PCBP2Q15366 ATP6V0E2-206ENST00000471877 1766 ntTSL 214.02□□□□□ -0.166e-13■□□□□ 10.2
PCBP2Q15366 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.216e-13■□□□□ 10.2
PCBP2Q15366 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.857e-8■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.97e-8■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 GRB2-209ENST00000581959 359 ntTSL 36.12□□□□□ -1.435e-12■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 FKBP10-204ENST00000464180 1129 ntTSL 219.29■□□□□ 0.681e-19■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 FKBP10-207ENST00000490938 837 ntTSL 214.73□□□□□ -0.051e-19■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.454e-11■□□□□ 10.1
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PCBP2Q15366 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.346e-9■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.464e-11■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.494e-11■□□□□ 10.1
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PCBP2Q15366 AIF1L-208ENST00000372314 3398 ntTSL 29.97□□□□□ -0.814e-11■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC9.71□□□□□ -0.866e-9■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 AIF1L-202ENST00000372297 418 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.944e-11■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 KPNA3-202ENST00000436760 588 ntTSL 26.05□□□□□ -1.444e-11■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 GOLGB1-205ENST00000482512 10295 ntTSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.464e-11■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 ACTR3-205ENST00000478928 5965 ntTSL 22.89□□□□□ -1.956e-9■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 EIF6-205ENST00000440766 798 ntTSL 215.32■□□□□ 0.042e-32■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 SLX1A-206ENST00000565081 1558 ntTSL 219.85■□□□□ 0.776e-15■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 SLX1A-SULT1A3-204ENST00000567520 2227 ntTSL 219.72■□□□□ 0.756e-15■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 SLX1A-204ENST00000563995 589 ntTSL 318.6■□□□□ 0.576e-15■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 SLX1A-SULT1A3-206ENST00000569959 2424 ntTSL 217.83■□□□□ 0.446e-15■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 SLX1A-SULT1A3-205ENST00000568997 2834 ntTSL 217.7■□□□□ 0.426e-15■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.386e-15■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.326e-15■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 SLX1A-SULT1A3-201ENST00000561824 1838 ntTSL 217.01■□□□□ 0.316e-15■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.226e-15■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 NECAB3-210ENST00000484824 596 ntTSL 217.07■□□□□ 0.323e-8■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.442e-13■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 ESYT1-206ENST00000550515 716 ntTSL 212.21□□□□□ -0.452e-13■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-6■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 MAGI2-225ENST00000636234 5702 ntTSL 54.08□□□□□ -1.765e-6■□□□□ 10.1
PCBP2Q15366 IPO9-202ENST00000456707 609 ntTSL 39.07□□□□□ -0.969e-12■□□□□ 10
PCBP2Q15366 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.159e-12■□□□□ 10
PCBP2Q15366 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.933e-9■□□□□ 10
PCBP2Q15366 COPE-208ENST00000598969 1770 ntTSL 520.3■□□□□ 0.843e-9■□□□□ 10
PCBP2Q15366 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.373e-9■□□□□ 10
PCBP2Q15366 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.373e-9■□□□□ 10
PCBP2Q15366 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-9■□□□□ 10
PCBP2Q15366 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.263e-9■□□□□ 10
PCBP2Q15366 YIF1B-206ENST00000586319 936 ntTSL 316.44■□□□□ 0.223e-9■□□□□ 10
PCBP2Q15366 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.193e-9■□□□□ 10
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PCBP2Q15366 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.133e-9■□□□□ 10
PCBP2Q15366 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.153e-9■□□□□ 10
PCBP2Q15366 COPE-205ENST00000595984 434 ntTSL 311.62□□□□□ -0.553e-9■□□□□ 10
PCBP2Q15366 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-25■□□□□ 10
PCBP2Q15366 COPE-210ENST00000600528 261 ntTSL 38.74□□□□□ -1.013e-9■□□□□ 10
PCBP2Q15366 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.061e-25■□□□□ 10
PCBP2Q15366 COX6B1-203ENST00000590618 290 ntTSL 36.65□□□□□ -1.341e-25■□□□□ 10
PCBP2Q15366 OXA1L-208ENST00000483939 1224 ntTSL 212.27□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.362e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.542e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-204ENST00000417962 2306 ntTSL 218.43■□□□□ 0.542e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-214ENST00000486344 713 ntTSL 217.3■□□□□ 0.362e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-212ENST00000465449 1739 ntTSL 217.08■□□□□ 0.322e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.182e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.162e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.112e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.12e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-216ENST00000494854 1908 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.042e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-218ENST00000497863 972 ntTSL 214.35□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-211ENST00000460758 1297 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.462e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 SHISA5-213ENST00000466424 673 ntTSL 211.16□□□□□ -0.622e-6■□□□□ 10
PCBP2Q15366 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.823e-14■□□□□ 10
PCBP2Q15366 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.73e-14■□□□□ 10
PCBP2Q15366 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.573e-14■□□□□ 10
PCBP2Q15366 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.753e-14■□□□□ 10
PCBP2Q15366 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.753e-14■□□□□ 10
PCBP2Q15366 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.593e-10■□□□□ 10
PCBP2Q15366 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.593e-10■□□□□ 10
PCBP2Q15366 PSME2-211ENST00000559613 300 ntTSL 32.9□□□□□ -1.953e-10■□□□□ 10
PCBP2Q15366 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.155e-32■□□□□ 10
PCBP2Q15366 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.025e-32■□□□□ 10
PCBP2Q15366 FADS2-213ENST00000523235 5073 ntTSL 213.76□□□□□ -0.215e-32■□□□□ 10
PCBP2Q15366 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.335e-32■□□□□ 10
PCBP2Q15366 ACSM3-203ENST00000501740 839 ntTSL 512.8□□□□□ -0.364e-10■□□□□ 10
PCBP2Q15366 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 411.1□□□□□ -0.634e-10■□□□□ 10
PCBP2Q15366 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 410.69□□□□□ -0.74e-10■□□□□ 10
PCBP2Q15366 MAP3K11-202ENST00000524848 2139 ntTSL 219.37■□□□□ 0.698e-7■□□□□ 10
PCBP2Q15366 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.638e-7■□□□□ 10
PCBP2Q15366 MAP3K11-213ENST00000534432 664 ntTSL 317.83■□□□□ 0.448e-7■□□□□ 10
PCBP2Q15366 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.098e-7■□□□□ 10
PCBP2Q15366 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.18e-7■□□□□ 10
PCBP2Q15366 TAB2-207ENST00000606797 677 ntTSL 57.3□□□□□ -1.242e-7■□□□□ 10
PCBP2Q15366 TAB2-203ENST00000470466 4199 ntTSL 1 (best)6.26□□□□□ -1.412e-7■□□□□ 10
PCBP2Q15366 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.982e-7■□□□□ 10
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