Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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