Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTCH1Q13635 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTCH1Q13635 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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