Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms