Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTBP2P56545 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms