Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms