Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA4P51532 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms