Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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VEGFBP49765 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VEGFBP49765 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VEGFBP49765 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VEGFBP49765 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VEGFBP49765 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VEGFBP49765 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VEGFBP49765 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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