Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFNP31947 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFNP31947 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms