Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCND2P30279 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCND2P30279 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCND2P30279 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms