Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KDM5AP29375 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms