Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD1P28340 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD1P28340 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD1P28340 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD1P28340 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD1P28340 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD1P28340 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD1P28340 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms