Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDSP20132 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDSP20132 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDSP20132 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms