Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms