Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms