Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCAP01258 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms